Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHDC3Q9BQ90 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHDC3Q9BQ90 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms