Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF25Q9BQ70 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms