Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC41A2Q96JW4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC41A2Q96JW4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms