Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRIQ1Q96JM4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC33.14■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
LRRIQ1Q96JM4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
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