Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG1Q96JA1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms