Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC41.29■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC41.28■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
RB1CC1Q8TDY2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC41.19■■■■■ 4.19
RB1CC1Q8TDY2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms