Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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