Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms