Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms