Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1A1P5Q5VTE0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEF1A1P5Q5VTE0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEF1A1P5Q5VTE0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEF1A1P5Q5VTE0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEF1A1P5Q5VTE0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEF1A1P5Q5VTE0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEF1A1P5Q5VTE0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEF1A1P5Q5VTE0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEF1A1P5Q5VTE0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEF1A1P5Q5VTE0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEF1A1P5Q5VTE0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEF1A1P5Q5VTE0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEF1A1P5Q5VTE0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EEF1A1P5Q5VTE0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms