Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS90

Gm11992, Uncharacterized protein C7orf57 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11992Q5SS90 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm11992Q5SS90 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms