Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms