Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC39A12Q504Y0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms