Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf22Q49AR2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf22Q49AR2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf22Q49AR2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf22Q49AR2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf22Q49AR2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf22Q49AR2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf22Q49AR2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf22Q49AR2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf22Q49AR2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf22Q49AR2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf22Q49AR2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf22Q49AR2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf22Q49AR2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms