Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms