Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc34Q3UI66 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms