Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RTN1Q16799 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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