Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FXNQ16595 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FXNQ16595 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FXNQ16595 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FXNQ16595 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FXNQ16595 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FXNQ16595 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FXNQ16595 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FXNQ16595 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FXNQ16595 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FXNQ16595 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FXNQ16595 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FXNQ16595 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FXNQ16595 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FXNQ16595 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FXNQ16595 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FXNQ16595 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FXNQ16595 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FXNQ16595 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FXNQ16595 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FXNQ16595 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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FXNQ16595 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FXNQ16595 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FXNQ16595 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FXNQ16595 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FXNQ16595 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FXNQ16595 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FXNQ16595 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FXNQ16595 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FXNQ16595 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FXNQ16595 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FXNQ16595 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FXNQ16595 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
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FXNQ16595 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FXNQ16595 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FXNQ16595 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FXNQ16595 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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FXNQ16595 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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FXNQ16595 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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FXNQ16595 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FXNQ16595 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FXNQ16595 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FXNQ16595 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FXNQ16595 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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FXNQ16595 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FXNQ16595 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FXNQ16595 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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FXNQ16595 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FXNQ16595 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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FXNQ16595 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FXNQ16595 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FXNQ16595 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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FXNQ16595 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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FXNQ16595 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FXNQ16595 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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FXNQ16595 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FXNQ16595 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FXNQ16595 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FXNQ16595 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FXNQ16595 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FXNQ16595 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FXNQ16595 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FXNQ16595 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FXNQ16595 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FXNQ16595 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FXNQ16595 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FXNQ16595 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FXNQ16595 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FXNQ16595 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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