Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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