Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKD1Q15139 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms