Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCAPD2Q15021 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCAPD2Q15021 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms