Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNGB1Q14028 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms