Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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