Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SHROOM2Q13796 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
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SHROOM2Q13796 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHROOM2Q13796 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
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