Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUNX3Q13761 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
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