Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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