Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB3Q13509 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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TUBB3Q13509 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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TUBB3Q13509 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TUBB3Q13509 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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