Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA4Q13439 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA4Q13439 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA4Q13439 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA4Q13439 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA4Q13439 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA4Q13439 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GOLGA4Q13439 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GOLGA4Q13439 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GOLGA4Q13439 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GOLGA4Q13439 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GOLGA4Q13439 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GOLGA4Q13439 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms