Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 GRS1YBR121C 2004 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 RTC5YOR118W 1704 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 ARP5YNL059C 2268 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 HOM3YER052C 1584 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YER067C-AYER067C-A 324 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YGR107WYGR107W 450 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YGR176WYGR176W 348 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YRA2YKL214C 612 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YAR075WYAR075W 474 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 LAP3YNL239W 1365 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 LEU1YGL009C 2340 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 TRE1YPL176C 2352 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YCR090CYCR090C 549 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 GRX2YDR513W 432 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 API2YDR525W 330 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YER107W-AYER107W-A 321 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 BNA6YFR047C 888 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 MRM2YGL136C 963 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 OTU2YHL013C 924 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 CRG1YHR209W 876 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 ERG2YMR202W 669 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YNL198CYNL198C 303 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 MSM1YGR171C 1728 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 SOF1YLL011W 1470 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 PHO90YJL198W 2646 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YNL095CYNL095C 1929 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 AYT1YLL063C 1425 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 GLT1YDL171C 6438 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 MRPL11YDL202W 750 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 SPO73YER046W 432 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YGR069WYGR069W 336 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 MPC3YGR243W 441 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 AAR2YBL074C 1068 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YOR365CYOR365C 2112 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 IMD2YHR216W 1572 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 RIM15YFL033C 5313 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 MGS1YNL218W 1764 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 CDC48YDL126C 2508 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YDR417CYDR417C 372 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 GAL83YER027C 1254 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YOS1YER074W-A 258 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YER187WYER187W 426 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 DPH1YIL103W 1278 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 LDB18YLL049W 540 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 RPL21BYPL079W 483 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 NUD1YOR373W 2556 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 SPB4YFL002C 1821 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 UGA1YGR019W 1416 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 SED4YCR067C 3198 nt4.71□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 YTA12YMR089C 2478 nt4.71□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 SUP35YDR172W 2058 nt4.71□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 ACS2YLR153C 2052 nt4.71□□□□□ -1.65
TY1A-NL1Q12391 SRD1YCR018C 666 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YPT32YGL210W 669 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 ERV1YGR029W 570 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 ECM4YKR076W 1113 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 PAI3YMR174C 207 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YOR277CYOR277C 309 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 snR32snR32 188 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 OCA5YHL029C 2040 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YBP2YGL060W 1926 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 PWP1YLR196W 1731 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 NOP2YNL061W 1857 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 BUD14YAR014C 2130 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 TEA1YOR337W 2280 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 SSF2YDR312W 1362 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 AAD4YDL243C 990 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YDR115WYDR115W 318 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 UTR4YEL038W 684 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YER137W-AYER137W-A 306 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 SCW4YGR279C 1161 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 EOS1YNL080C 1101 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 RPS10AYOR293W 318 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 IRC16YPR038W 360 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YCL022CYCL022C 516 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 MAK5YBR142W 2322 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 UBX5YDR330W 1503 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YOR1YGR281W 4434 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YHI9YHR029C 885 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 VMA10YHR039C-A 345 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YIL054WYIL054W 318 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 MSS4YDR208W 2340 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 OSH6YKR003W 1347 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 DAL5YJR152W 1632 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 MMP1YLL061W 1752 nt4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.6 ms