Protein–RNA interactions for Protein: Q12085

TY1A-GR1, Transposon Ty1-GR1 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-GR1Q12085 YMR141CYMR141C 309 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 RPL13BYMR142C 600 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 YPL107WYPL107W 747 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 YPL197CYPL197C 414 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 YBR242WYBR242W 717 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 TUP1YCR084C 2142 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 PUP2YGR253C 783 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 YMR295CYMR295C 594 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 RPS15YOL040C 429 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 YOR331CYOR331C 558 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 YAR1YPL239W 603 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 ARN1YHL040C 1884 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 VID30YGL227W 2877 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 YDR274CYDR274C 372 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 PMI40YER003C 1290 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 BNA6YFR047C 888 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 ARC1YGL105W 1131 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 KEX1YGL203C 2190 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 SOL4YGR248W 768 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 DED81YHR019C 1665 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 EPT1YHR123W 1176 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 SPC1YJR010C-A 285 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 BUL1YMR275C 2931 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 RRT16YNL105W 429 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 MNT4YNR059W 1743 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 ICY2YPL250C 411 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 MBA1YBR185C 837 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 BIK1YCL029C 1323 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-GR1Q12085 NHA1YLR138W 2958 nt4.59□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 SWC4YGR002C 1431 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 MTM1YGR257C 1101 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 RIM9YMR063W 720 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 VAM10YOR068C 345 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 SWC3YAL011W 1878 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 DAL5YJR152W 1632 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 GPR1YDL035C 2886 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 PTR3YFR029W 2037 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 VHC1YBR235W 3363 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 MAK31YCR020C-A 267 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 MFA1YDR461W 111 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 SPO73YER046W 432 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 OM45YIL136W 1182 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 HOC1YJR075W 1191 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 NNT1YLR285W 786 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YPR174CYPR174C 666 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 AXL2YIL140W 2472 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YFL034WYFL034W 3222 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 STB2YMR053C 2553 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 HAP1YLR256W 4509 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 PUT2YHR037W 1728 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 IDP2YLR174W 1239 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 PDP3YLR455W 915 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YOR282WYOR282W 321 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YPL035CYPL035C 348 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 AFT2YPL202C 1251 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 snR17bsnR17b 332 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YPR096CYPR096C 303 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 SYF1YDR416W 2580 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 MPH3YJR160C 1809 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 GLN4YOR168W 2430 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 GDI1YER136W 1356 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 TGL3YMR313C 1929 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 snR59snR59 78 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 snR68snR68 136 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 THI13YDL244W 1023 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 LCL3YGL085W 825 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 ERV1YGR029W 570 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YGR153WYGR153W 654 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 MAM33YIL070C 801 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YRA2YKL214C 612 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 ERG3YLR056W 1098 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 BSC3YLR465C 309 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YNL043CYNL043C 321 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 THI12YNL332W 1023 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 GRE2YOL151W 1029 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 ARR2YPR200C 393 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 SYO1YDL063C 1863 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 SHE4YOR035C 2370 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 NDC80YIL144W 2076 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 STE20YHL007C 2820 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YDL071CYDL071C 375 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 AAD4YDL243C 990 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YER084WYER084W 387 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 AUA1YFL010W-A 285 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YPT32YGL210W 669 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 ECT1YGR007W 972 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 FYV4YHR059W 393 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 ABM1YJR108W 372 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 PRE5YMR314W 705 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 NOP15YNL110C 663 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YOL134CYOL134C 390 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YPL225WYPL225W 441 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YBR209WYBR209W 318 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 YMR221CYMR221C 1515 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-GR1Q12085 FMP25YLR077W 1752 nt4.54□□□□□ -1.68
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