Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou6f1Q07916 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou6f1Q07916 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms