Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNDQ07001 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms