Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RykQ01887 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RykQ01887 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RykQ01887 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RykQ01887 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RykQ01887 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RykQ01887 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RykQ01887 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RykQ01887 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RykQ01887 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RykQ01887 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RykQ01887 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RykQ01887 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RykQ01887 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RykQ01887 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RykQ01887 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RykQ01887 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RykQ01887 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RykQ01887 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RykQ01887 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RykQ01887 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RykQ01887 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RykQ01887 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RykQ01887 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RykQ01887 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RykQ01887 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RykQ01887 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RykQ01887 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RykQ01887 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RykQ01887 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RykQ01887 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RykQ01887 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RykQ01887 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RykQ01887 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RykQ01887 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RykQ01887 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RykQ01887 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RykQ01887 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RykQ01887 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RykQ01887 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RykQ01887 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RykQ01887 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RykQ01887 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RykQ01887 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RykQ01887 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RykQ01887 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RykQ01887 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RykQ01887 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RykQ01887 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RykQ01887 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RykQ01887 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RykQ01887 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RykQ01887 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RykQ01887 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RykQ01887 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RykQ01887 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RykQ01887 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RykQ01887 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RykQ01887 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RykQ01887 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RykQ01887 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RykQ01887 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RykQ01887 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RykQ01887 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RykQ01887 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RykQ01887 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RykQ01887 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RykQ01887 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RykQ01887 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RykQ01887 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RykQ01887 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RykQ01887 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RykQ01887 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RykQ01887 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RykQ01887 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RykQ01887 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RykQ01887 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RykQ01887 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RykQ01887 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RykQ01887 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RykQ01887 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms