Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MDM2Q00987 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms