Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARF6P62330 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARF6P62330 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARF6P62330 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARF6P62330 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARF6P62330 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARF6P62330 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARF6P62330 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARF6P62330 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARF6P62330 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARF6P62330 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARF6P62330 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARF6P62330 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARF6P62330 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARF6P62330 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARF6P62330 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARF6P62330 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARF6P62330 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARF6P62330 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF6P62330 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms