Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP4BP1P59074 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms