Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPP55072 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPP55072 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPP55072 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPP55072 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPP55072 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPP55072 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPP55072 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPP55072 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPP55072 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPP55072 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPP55072 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPP55072 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPP55072 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPP55072 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPP55072 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPP55072 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPP55072 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPP55072 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPP55072 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPP55072 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPP55072 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPP55072 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPP55072 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPP55072 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPP55072 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPP55072 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPP55072 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPP55072 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPP55072 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPP55072 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPP55072 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPP55072 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPP55072 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPP55072 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPP55072 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPP55072 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPP55072 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPP55072 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPP55072 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPP55072 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPP55072 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPP55072 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPP55072 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPP55072 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPP55072 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPP55072 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPP55072 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPP55072 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPP55072 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPP55072 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPP55072 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPP55072 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPP55072 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPP55072 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPP55072 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPP55072 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPP55072 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPP55072 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPP55072 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPP55072 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPP55072 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPP55072 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPP55072 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPP55072 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPP55072 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPP55072 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPP55072 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPP55072 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPP55072 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCPP55072 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCPP55072 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCPP55072 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCPP55072 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPP55072 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPP55072 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPP55072 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPP55072 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPP55072 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPP55072 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPP55072 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPP55072 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPP55072 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms