Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms