Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE6CP51160 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms