Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTAP49354 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTAP49354 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTAP49354 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNTAP49354 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNTAP49354 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNTAP49354 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FNTAP49354 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNTAP49354 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FNTAP49354 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNTAP49354 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FNTAP49354 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNTAP49354 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FNTAP49354 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNTAP49354 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNTAP49354 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FNTAP49354 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNTAP49354 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNTAP49354 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FNTAP49354 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTAP49354 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTAP49354 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTAP49354 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTAP49354 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTAP49354 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTAP49354 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTAP49354 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTAP49354 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTAP49354 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTAP49354 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTAP49354 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTAP49354 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTAP49354 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTAP49354 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTAP49354 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTAP49354 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTAP49354 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTAP49354 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTAP49354 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTAP49354 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTAP49354 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTAP49354 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTAP49354 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTAP49354 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTAP49354 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTAP49354 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTAP49354 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTAP49354 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTAP49354 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTAP49354 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTAP49354 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTAP49354 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTAP49354 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTAP49354 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTAP49354 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNTAP49354 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNTAP49354 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNTAP49354 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FNTAP49354 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNTAP49354 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNTAP49354 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNTAP49354 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNTAP49354 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNTAP49354 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNTAP49354 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNTAP49354 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNTAP49354 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FNTAP49354 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNTAP49354 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNTAP49354 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNTAP49354 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNTAP49354 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNTAP49354 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNTAP49354 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNTAP49354 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNTAP49354 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNTAP49354 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNTAP49354 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNTAP49354 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNTAP49354 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNTAP49354 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNTAP49354 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms