Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms