Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms