Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms