Protein–RNA interactions for Protein: P25582

SPB1, 27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPB1P25582 FKH2YNL068C 2589 nt3.46□□□□□ -1.86
SPB1P25582 CDC5YMR001C 2118 nt3.46□□□□□ -1.86
SPB1P25582 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.45□□□□□ -1.86
SPB1P25582 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.45□□□□□ -1.86
SPB1P25582 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.45□□□□□ -1.86
SPB1P25582 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.45□□□□□ -1.86
SPB1P25582 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.45□□□□□ -1.86
SPB1P25582 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.45□□□□□ -1.86
SPB1P25582 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.45□□□□□ -1.86
SPB1P25582 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.45□□□□□ -1.86
SPB1P25582 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.45□□□□□ -1.86
SPB1P25582 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.45□□□□□ -1.86
SPB1P25582 SNX4YJL036W 1272 nt3.45□□□□□ -1.86
SPB1P25582 EMC2YJR088C 879 nt3.45□□□□□ -1.86
SPB1P25582 YLR416CYLR416C 399 nt3.45□□□□□ -1.86
SPB1P25582 VPS17YOR132W 1656 nt3.45□□□□□ -1.86
SPB1P25582 THR4YCR053W 1545 nt3.44□□□□□ -1.86
SPB1P25582 GCD2YGR083C 1956 nt3.44□□□□□ -1.86
SPB1P25582 SPT2YER161C 1002 nt3.44□□□□□ -1.86
SPB1P25582 IME1YJR094C 1083 nt3.44□□□□□ -1.86
SPB1P25582 CCE1YKL011C 1062 nt3.44□□□□□ -1.86
SPB1P25582 SWD2YKL018W 990 nt3.44□□□□□ -1.86
SPB1P25582 YKL131WYKL131W 522 nt3.44□□□□□ -1.86
SPB1P25582 HMX1YLR205C 954 nt3.44□□□□□ -1.86
SPB1P25582 INN1YNL152W 1230 nt3.44□□□□□ -1.86
SPB1P25582 HHF1YBR009C 312 nt3.44□□□□□ -1.86
SPB1P25582 SEC27YGL137W 2670 nt3.44□□□□□ -1.86
SPB1P25582 ARO1YDR127W 4767 nt3.43□□□□□ -1.86
SPB1P25582 RUB1YDR139C 234 nt3.43□□□□□ -1.86
SPB1P25582 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.43□□□□□ -1.86
SPB1P25582 YGL214WYGL214W 486 nt3.43□□□□□ -1.86
SPB1P25582 YGL242CYGL242C 546 nt3.43□□□□□ -1.86
SPB1P25582 SGN1YIR001C 753 nt3.43□□□□□ -1.86
SPB1P25582 PEX15YOL044W 1152 nt3.43□□□□□ -1.86
SPB1P25582 YPR027CYPR027C 834 nt3.43□□□□□ -1.86
SPB1P25582 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.43□□□□□ -1.86
SPB1P25582 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.43□□□□□ -1.86
SPB1P25582 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.43□□□□□ -1.86
SPB1P25582 KIN3YAR018C 1308 nt3.43□□□□□ -1.86
SPB1P25582 DPP1YDR284C 870 nt3.42□□□□□ -1.86
SPB1P25582 RSM27YGR215W 333 nt3.42□□□□□ -1.86
SPB1P25582 YNL320WYNL320W 855 nt3.42□□□□□ -1.86
SPB1P25582 BMS1YPL217C 3552 nt3.41□□□□□ -1.86
SPB1P25582 YAK1YJL141C 2424 nt3.41□□□□□ -1.86
SPB1P25582 VBA4YDR119W 2307 nt3.41□□□□□ -1.86
SPB1P25582 RRP42YDL111C 798 nt3.41□□□□□ -1.86
SPB1P25582 FAP7YDL166C 594 nt3.41□□□□□ -1.86
SPB1P25582 PET100YDR079W 336 nt3.41□□□□□ -1.86
SPB1P25582 ECM11YDR446W 909 nt3.41□□□□□ -1.86
SPB1P25582 OST5YGL226C-A 261 nt3.41□□□□□ -1.86
SPB1P25582 COX6YHR051W 447 nt3.41□□□□□ -1.86
SPB1P25582 SVP26YHR181W 687 nt3.41□□□□□ -1.86
SPB1P25582 TUM1YOR251C 915 nt3.41□□□□□ -1.86
SPB1P25582 YOR366WYOR366W 354 nt3.41□□□□□ -1.86
SPB1P25582 YBR053CYBR053C 1077 nt3.41□□□□□ -1.86
SPB1P25582 DIM1YPL266W 957 nt3.41□□□□□ -1.86
SPB1P25582 SPT10YJL127C 1923 nt3.4□□□□□ -1.86
SPB1P25582 SNT1YCR033W 3681 nt3.4□□□□□ -1.86
SPB1P25582 AI4Q0065 1671 nt3.4□□□□□ -1.86
SPB1P25582 AAD3YCR107W 1092 nt3.4□□□□□ -1.87
SPB1P25582 GRX2YDR513W 432 nt3.4□□□□□ -1.87
SPB1P25582 FOL2YGR267C 732 nt3.4□□□□□ -1.87
SPB1P25582 AIM25YJR100C 984 nt3.4□□□□□ -1.87
SPB1P25582 RAD33YML011C 534 nt3.4□□□□□ -1.87
SPB1P25582 OST6YML019W 999 nt3.4□□□□□ -1.87
SPB1P25582 YMR087WYMR087W 855 nt3.4□□□□□ -1.87
SPB1P25582 PIN4YBL051C 2007 nt3.4□□□□□ -1.87
SPB1P25582 MIC27YNL100W 705 nt3.4□□□□□ -1.87
SPB1P25582 CUP9YPL177C 921 nt3.4□□□□□ -1.87
SPB1P25582 YBR137WYBR137W 540 nt3.4□□□□□ -1.87
SPB1P25582 HRD1YOL013C 1656 nt3.39□□□□□ -1.87
SPB1P25582 PKH1YDR490C 2301 nt3.39□□□□□ -1.87
SPB1P25582 SLY41YOR307C 1362 nt3.39□□□□□ -1.87
SPB1P25582 NDC80YIL144W 2076 nt3.39□□□□□ -1.87
SPB1P25582 RPA14YDR156W 414 nt3.39□□□□□ -1.87
SPB1P25582 YDR491CYDR491C 492 nt3.39□□□□□ -1.87
SPB1P25582 SMT3YDR510W 306 nt3.39□□□□□ -1.87
SPB1P25582 YHR097CYHR097C 1101 nt3.39□□□□□ -1.87
SPB1P25582 RGI2YIL057C 495 nt3.39□□□□□ -1.87
SPB1P25582 SFH1YLR321C 1281 nt3.39□□□□□ -1.87
SPB1P25582 PPT2YPL148C 522 nt3.39□□□□□ -1.87
SPB1P25582 YPR053CYPR053C 456 nt3.39□□□□□ -1.87
SPB1P25582 PFK26YIL107C 2484 nt3.39□□□□□ -1.87
SPB1P25582 STT4YLR305C 5703 nt3.39□□□□□ -1.87
SPB1P25582 SAG1YJR004C 1953 nt3.39□□□□□ -1.87
SPB1P25582 IOC3YFR013W 2364 nt3.39□□□□□ -1.87
SPB1P25582 MRH4YGL064C 1686 nt3.39□□□□□ -1.87
SPB1P25582 GLC3YEL011W 2115 nt3.38□□□□□ -1.87
SPB1P25582 GPI13YLL031C 3054 nt3.38□□□□□ -1.87
SPB1P25582 ATP16YDL004W 483 nt3.38□□□□□ -1.87
SPB1P25582 NKP1YDR383C 717 nt3.38□□□□□ -1.87
SPB1P25582 MPS2YGL075C 1164 nt3.38□□□□□ -1.87
SPB1P25582 USE1YGL098W 738 nt3.38□□□□□ -1.87
SPB1P25582 YGR283CYGR283C 1026 nt3.38□□□□□ -1.87
SPB1P25582 YIR040CYIR040C 333 nt3.38□□□□□ -1.87
SPB1P25582 RPC25YKL144C 639 nt3.38□□□□□ -1.87
SPB1P25582 COQ9YLR201C 783 nt3.38□□□□□ -1.87
SPB1P25582 TEM1YML064C 738 nt3.38□□□□□ -1.87
SPB1P25582 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt3.38□□□□□ -1.87
SPB1P25582 END3YNL084C 1050 nt3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.7 ms