Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms