Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPREP23469 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPREP23469 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPREP23469 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPREP23469 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPREP23469 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPREP23469 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPREP23469 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPREP23469 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPREP23469 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPREP23469 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPREP23469 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPREP23469 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPREP23469 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPREP23469 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPREP23469 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPREP23469 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPREP23469 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPREP23469 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPREP23469 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPREP23469 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPREP23469 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPREP23469 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPREP23469 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPREP23469 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPREP23469 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPREP23469 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPREP23469 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPREP23469 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPREP23469 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPREP23469 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPREP23469 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPREP23469 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPREP23469 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPREP23469 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPREP23469 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPREP23469 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPREP23469 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPREP23469 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPREP23469 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPREP23469 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPREP23469 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPREP23469 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPREP23469 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPREP23469 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPREP23469 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPREP23469 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPREP23469 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPREP23469 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPREP23469 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPREP23469 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPREP23469 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPREP23469 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPREP23469 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPREP23469 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPREP23469 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPREP23469 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPREP23469 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPREP23469 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPREP23469 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPREP23469 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPREP23469 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPREP23469 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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