Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms