Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna4P07351 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms