Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYCNP04198 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MYCNP04198 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYCNP04198 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYCNP04198 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYCNP04198 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYCNP04198 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYCNP04198 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYCNP04198 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MYCNP04198 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MYCNP04198 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYCNP04198 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYCNP04198 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYCNP04198 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYCNP04198 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYCNP04198 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYCNP04198 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYCNP04198 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MYCNP04198 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MYCNP04198 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYCNP04198 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MYCNP04198 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MYCNP04198 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYCNP04198 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYCNP04198 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYCNP04198 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYCNP04198 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MYCNP04198 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYCNP04198 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYCNP04198 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYCNP04198 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYCNP04198 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYCNP04198 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MYCNP04198 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYCNP04198 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYCNP04198 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYCNP04198 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYCNP04198 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYCNP04198 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
MYCNP04198 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYCNP04198 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYCNP04198 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYCNP04198 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYCNP04198 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYCNP04198 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MYCNP04198 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MYCNP04198 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MYCNP04198 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYCNP04198 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYCNP04198 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYCNP04198 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYCNP04198 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYCNP04198 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYCNP04198 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYCNP04198 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYCNP04198 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYCNP04198 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYCNP04198 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MYCNP04198 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYCNP04198 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYCNP04198 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MYCNP04198 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYCNP04198 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MYCNP04198 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MYCNP04198 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MYCNP04198 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MYCNP04198 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MYCNP04198 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYCNP04198 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MYCNP04198 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MYCNP04198 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYCNP04198 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYCNP04198 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYCNP04198 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYCNP04198 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYCNP04198 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MYCNP04198 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYCNP04198 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYCNP04198 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MYCNP04198 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MYCNP04198 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms