Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POMCP01189 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POMCP01189 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POMCP01189 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POMCP01189 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POMCP01189 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POMCP01189 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POMCP01189 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POMCP01189 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POMCP01189 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POMCP01189 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POMCP01189 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POMCP01189 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POMCP01189 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POMCP01189 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POMCP01189 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POMCP01189 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POMCP01189 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POMCP01189 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POMCP01189 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POMCP01189 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POMCP01189 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POMCP01189 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POMCP01189 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POMCP01189 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POMCP01189 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POMCP01189 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POMCP01189 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POMCP01189 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POMCP01189 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POMCP01189 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POMCP01189 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POMCP01189 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POMCP01189 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POMCP01189 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POMCP01189 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POMCP01189 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POMCP01189 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POMCP01189 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POMCP01189 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POMCP01189 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POMCP01189 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POMCP01189 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POMCP01189 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POMCP01189 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POMCP01189 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POMCP01189 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POMCP01189 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POMCP01189 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POMCP01189 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POMCP01189 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POMCP01189 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POMCP01189 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POMCP01189 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POMCP01189 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POMCP01189 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POMCP01189 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POMCP01189 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POMCP01189 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POMCP01189 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POMCP01189 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POMCP01189 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POMCP01189 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POMCP01189 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POMCP01189 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POMCP01189 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POMCP01189 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POMCP01189 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POMCP01189 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POMCP01189 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POMCP01189 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POMCP01189 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POMCP01189 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POMCP01189 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POMCP01189 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POMCP01189 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POMCP01189 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POMCP01189 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POMCP01189 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POMCP01189 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POMCP01189 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms